Το Πανεπιστήμιο Θεσσαλίας (ΠΑΘΕ) συμμετέχει στο έργο με 2 Εργαστήρια της Σχολής Γεωπονικών Επιστημών: α) Το Εργαστήριο Υδατοκαλλιεργειών (ΕΥΔ) του Τμήματος Γεωπονίας Ιχθυολογίας και Υδάτινου Περιβάλλοντος (www.diae.uth.gr) και β) το Εργαστήριο Γεωργικών Κατασκευών και Ελέγχου Περιβάλλοντος (ΕΓΚΕΠ) του Τμήματος Γεωπονίας Φυτικής Παραγωγής και Αγροτικού Περιβάλλοντος (www.agr.uth.gr). Μεταξύ των στόχων της Σχολής είναι η διεξαγωγή εφαρμοσμένης και τεχνολογικής έρευνας που οδηγεί σε νέα προϊόντα και υπηρεσίες με περιβαλλοντικό, οικονομικό και κοινωνικό αντίκτυπο.
Το ΕΥΔ εξυπηρετεί τις εκπαιδευτικές-ερευνητικές ανάγκες του ΠΑΘΕ στα γνωστικά αντικείμενα της υδατοκαλλιέργειας και της τεχνολογίας ιχθυοτροφών μεταξύ άλλων. Το προσωπικό του διαθέτει πολυετή εμπειρία σε θέματα εκτροφής-διατροφής ιχθύων και τεχνολογίας ιχθυοτροφών. Επίσης, το προσωπικό του έχει πολυετή εμπειρία στη διαχείριση και υλοποίηση εθνικών και διεθνών ερευνητικών προγραμμάτων έχοντας συμμετάσχει σε περισσότερα από 30 ερευνητικά έργα, δημοσιεύοντας περισσότερα από 60 άρθρα σε διεθνή περιοδικά με κριτές. Το ΕΥΔ διαθέτει όλες τις βασικές υποδομές που θα χρειαστούν, όπως Πειραματικό Σταθμό Υδατοκαλλιεργειών (με άδεια λειτουργίας εγκατάστασης και χρήσης ζώων εργαστηρίου EL-43BIO/exp-01) για τη διεξαγωγή των διατροφικών πειραμάτων και πελλετομηχανή για την παρασκευή ιχθυοτροφών, όργανα αναλύσεων θρεπτικής σύστασης τροφών, ιχθύων και μικροφυκών.
ΤΟ ΕΓΚΕΠ (http://lacec.agr.uth.gr/) εξυπηρετεί τις εκπαιδευτικές-ερευνητικές ανάγκες του ΠΑΘΕ σε θέματα που αφορούν τον σχεδιασμό και την κατασκευή γεωργικών κατασκευών, θερμοκηπίων και υδροπονικών συστημάτων μεταξύ άλλων. Τα μέλη του ΕΓΚΕΠ έχουν συμμετάσχει σε περισσότερα από 40 ερευνητικά έργα, έχουν δημοσιεύσει περισσότερα από 70 άρθρα σε διεθνή περιοδικά με κριτές και περισσότερα από 200 σε πρακτικά εθνικών και διεθνών συνεδρίων. Το εργαστήριο δραστηριοποιείται με την καλλιέργεια μικροφυκών με συνέργειες με το ΕΥΔ και τη βιομηχανία βιοκαυσίμων, έχοντας αποκτήσει σχετική τεχνογνωσία επί του θέματος.
Τα 2 εργαστήρια του ΠΑΘΕ συνεργάζονται ερευνητικά εδώ και μια 5ετία στην καλλιέργεια και τη χρήση μικροφυκών σε ιχθυοτροφές. Επίσης, τα μέλη της ομάδας έργου συνεργάζονται με άλλους ερευνητικούς φορείς της ημεδαπής και αλλοδαπής στο σχετικό αντικείμενο, ενώ έχει εγκαθιδρύσει συνέργιες και με τη βιομηχανία ιχθυοτροφών και τη βιομηχανία βιοκαυσίμων.